Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms