Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spag9Q58A65 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms