Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms