Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Khdc1cQ4KL78 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Khdc1cQ4KL78 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc1cQ4KL78 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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