Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt35Q497I4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms