Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms