Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms