Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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