Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd13cQ3UX43 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd13cQ3UX43 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms