Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn4Q3UWL8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms