Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms