Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgef40Q3UPH7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms