Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms