Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms