Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms