Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms