Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms