Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gse1Q3U3C9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms