Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms