Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms