Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.1 ms