Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms