Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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