Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms