Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms