Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms