Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms