Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms