Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms