Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spatc1Q148B6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spatc1Q148B6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spatc1Q148B6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Spatc1Q148B6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms