Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms