Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps8Q0P5W1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms