Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q08AU9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q08AU9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms