Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms