Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms