Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms