Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mex3cQ05A36 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms