Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox13Q04891 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms