Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms