Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms