Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms