Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms