Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms