Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms