Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1sQ02789 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms