Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms