Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nhlh1Q02576 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nhlh1Q02576 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nhlh1Q02576 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nhlh1Q02576 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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