Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp39Q02525 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Zfp39Q02525 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp39Q02525 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms