Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VcpQ01853 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VcpQ01853 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms