Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms